#!/bin/bash
# ./batch_fastqc.sh
# 遍历当前目录下所有.fastq文件，调用FastQC进行质量检测
OUTPUT_DIR="fastqc_results"
mkdir -p "$OUTPUT_DIR"

for file in *.fastq; do
	echo "Processing $file ..."
	fastqc "$file" -o "$OUTPUT_DIR"
done

echo "所有文件处理完成，结果保存在 $OUTPUT_DIR 目录下。"